新華書店是中華人民共和國國有圖書發行企業，隸屬于中共中央宣傳部，中國出版集團之下，是國家官方的書店，也是國家刊物宣傳與發售處之一，新華書店總店不同時期曾直屬于中央黨報委員會、中央出版委員會、中央出版局、中央宣傳部、國家出版總署、文化部、國家出版局、國家新聞出版總署等領導機關。2002年4月，按照中央文化體制改革戰略部署，新華書店總店成為組建中國出版集團的十二家重要成員單位之一。其發行網點遍及全國城鎮，其管理機構為新華書店總店。

新華書店總店是中央一級圖書、音像出版物大型批發企業，隸屬中國出版集團。新華書店總店具有豐富的書業營銷運作經驗，在長期發展中，構筑了全國性的購銷網絡、倉儲運輸網絡和資金結算網絡，具備集約化、規模化經營條件。為適應圖書市場日益發展的需要，在圖書發行業務中加大高新科技手段的利用，正在建設全國出版物信息網絡系統和企業管理系統。企業機構健全，實力雄厚，擁有固定資產逾3億元，營業面積及倉儲場地近8萬平方米，承擔向全國5000余家各級新華書店及社會書店辦理中央一級、北京地區及全國各地500多家出版社的出版物進發貨業務。

新華書店網上商城隸屬于新華互聯電子商務有限責任公司。新華互聯電子商務有限責任公司成立于2015年10月20日，是由新華書店總店聯合全國各省市新華書店共同出資，以新華書店網上商城的建設和運營為核心的高新技術企業。公司圍繞“立足文化，服務產業”的宗旨，建立適應互聯網與移動互聯網時代環境的全品種、優質化的出版物發行電商平臺，形成線上營銷和線下體驗相結合的出版物發行新模式，努力成為具有核心競爭力的現代科技文化企業。