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山東中醫藥大學創建于1958年，1978年被確定為全國重點建設的中醫院校，1981年成為山東省重點高校，是教育部本科教學工作水平評估優秀學校、山東省人民政府和國家中醫藥管理局共建中醫藥院校、山東省應用基礎型人才培養特色名校、山東省省級文明校園、山東省高水平學科和高水平大學。學校在省屬高校中擁有國家重點學科最多，首批獲得碩士、博士學位授權，首批成為國家“973”項目第一承擔單位，碩士點數量位居全國同類院校前列。

學校2007年由濟南市歷下區主體遷入扁鵲故里——長清，現有位于濟南市的長清校區、千佛山校區、國際醫學中心校區和位于青島市的海洋中藥研究院，現有中醫基礎理論、中醫醫史文獻、中醫內科學等國家重點學科，擁有多個博士學位授權一級學科、碩士學位授權一級學科。中醫學入選山東省“高峰學科”，中西醫結合、中藥學入選山東省“優勢特色學科”，生物醫學工程入選山東省“培育學科”。還有多個項目入選國家高水平中醫藥重點學科建設項目。并積極打造中醫藥拔尖創新人才“山東模式”，開設扁鵲班、扁鵲書院以及華佗班、倉公班、鳳梧班，王琦書院齊魯分院落戶學校，中醫專業少年班典型經驗被《人民日報》整版報道。

學校現有多個中醫學、中藥學、中西醫結合博士后科研流動站，教育部重點實驗室，國家中醫藥管理局三級重點實驗室，國家中醫藥管理局重點研究室，全國學術流派傳承工作室。還擁有國家中醫臨床研究基地、國家重大新藥創制平臺（山東）中藥單元平臺。國家中醫藥管理局中醫藥特色療法評價推廣中心落戶學校。先后建設海洋中藥研究院（青島中醫藥科學院）、中醫藥創新研究院、魯澳中醫藥產業研究院、藥物研究院（中醫藥健康產業技術研究院）、中醫文獻與文化研究院，成立全球首家石墨烯醫學研究院、全國首家中醫藥抗病毒研究基地。

中醫醫史文獻學術水平全國一流，新中國成立以來規模最大最系統的中醫藥古籍整理保護計劃項目《中華醫藏》學術辦公室掛靠學校。擦亮儒醫文化、扁鵲故里、針砭發源地“三張名片”，先后承辦尼山世界中醫藥論壇、“泰山論灸”“沂山論健”等重大活動。打造全國首家省級中醫藥文化協同創新中心，成為省高等學校示范協同創新中心。山東省中醫藥文化傳承發展研究院落戶學校，學校與山東省委宣傳部共建中醫藥文化與中華文明研究中心。建設全國首個“中華傳統美德與人的健康生活方式”哲學與社會科學重點實驗室，打造中醫生活化研究推廣“山東樣板”。山東省中醫藥博物館獲全國中醫藥文化宣傳教育基地、山東省社會科學普及教育基地。

學校與世界上近200所高等教育、醫療科研機構建立合作關系，是世界針聯對外交往工作委員會以及世界中聯中醫外治、脈象、抗病毒等專業委員會的掛靠單位，獲批建設“國家中醫藥服務出口基地”“中國—波蘭中醫藥中心”“中醫外治國際合作基地”“中西醫結合眼視光與近視防控國際合作基地”、山東-肯尼亞傳統醫藥合作中心等國家和省級國際合作平臺。

1958年9月，山東中醫學院創建。

1964年前后，1956年創辦的山東省中醫進修學校被撤銷，人員轉入山東中醫學院。

1970年，山東中醫學院與山東醫學院合并為山東醫學院，搬遷到山東省新泰縣樓德鎮。

1975年10月，經國務院批準恢復山東中醫學院建制，遷回濟南。

1978年，被確定為全國重點建設的中醫院校。

1981年，被山東省人民政府公布為省屬重點大學，同年被國務院學位委員會批準為碩士學位授予單位。

1986年，被批準為博士學位授予單位。

1996年，經原國家教委批準，學校更名為山東中醫藥大學。

2007年，學校由濟南市歷下區主體遷至長清大學科技園，同年在教育部本科教學工作水平評估中獲評“優秀”。

2011年底，入選國家建設高水平大學公派研究生項目。

2012年，被確定為山東省首批重點建設的“應用基礎型人才培養特色名校”。

2016年7月，山東中醫藥大學青島中醫藥科學院揭牌。同年11月，入選山東省一流學科建設高校。

2018年12月，加入山東省高等學校“長青聯盟”。

2019年8月，山東中醫藥大學被教育部評為全國創新創業典型經驗高校。11月，山東省人民政府和國家中醫藥管理局舉行共建山東中醫藥大學協議簽約儀式。

2022年8月，發起成立山東省中醫藥文化傳播學會。

2023年10月，牽頭成立全國醫養結合行業產教融合共同體。

2024年1月12日，山東中醫藥大學中藥監管科學研究中心成立。10月12日，山東中醫藥大學循證醫學研究中心揭牌。

以上信息源自官網，數據截止至2025年6月，請以官網為準！