歷史沿革

1978年，巧家縣政府在藥山籌建“蕎山森林管理站”。

1980年，設立“藥山森林公安派出所”。

1984年4月5日，云南省政府批準建立藥山省級自然保護區，劃定面積10215公頃，并在藥山鎮設立了藥山自然保護區管理所。

1990年后，由于在巧縣內的楊家灣發現了巧家五針松群落（1999年被國家認定為Ⅰ級重點保護野生植物），以及在金沙江邊發現國家Ⅱ級重點野生植物——攀枝花蘇鐵群落，保護區范圍擴大。

2003年，進行自然保護區科學考察，正式確定了保護區邊界，面積擴大到20141公頃。

2005年，經國務院批準正式列藥山為國家級自然保護區（國辦發[2005]40號文），面積20141公頃，藥山自然保護區管理所也升格為管理局。

2005年11月，巧縣林業局和保護區管理局委托云南省林業調查規劃設計院制定“云南藥山國家級自然保護區總體規劃”，通過專家評審并上報。

2006年2月，巧縣林業局和保護管理局委托省林業調查規劃設計院開展“保護區建設工程可行性研究”，《可研報告》經過專家評審，并隨云林計財[2006]33號文件上報國家林業局。

2006年6月，國家林業局以林計批字[2006]159號文《國家林業局關于保護區基礎建設項目可行性研究報告的批復》，對該項目主要建設內容及投資作了批復。

2007年3月市、巧縣編委批準成立云南藥山國家級自然保護區管理局，為巧家縣人民政府管理的副處級參公管理事業單位，業務上受林業部門指導。

地理環境

位置

云南藥山國家級自然保護區位于云南省昭通市巧家縣境內，由南北互不相連的兩片組成。

北邊的藥山片為保護區主體部分，地處金沙江與其主要支流牛欄江的匯合處，地理坐標，東經102°57′47″～103°10′13″，北緯27°08′54″～27°25′31″；南邊的楊家灣片位于巧家縣城中南部，地理坐標：東經102°59′59″～103°01′33″，北緯26°50′38″～26°53′47″。

氣候

保護區所在地域屬我國西部型的低緯高原季風氣候，有著日溫差大，年溫差小，干濕季分明等特點，雨熱同期，干暖季立體氣候明顯。氣溫隨海拔高度的增加而呈明顯的降低之勢。熱月（7月）平均氣溫從27.3℃下降到13.5℃；冷月（1月）平均氣溫從12.2℃下降到-0.1℃，降水量也隨海拔高度的不同而差異明顯。海拔1200米以下左右，年降水量不足1000毫米；海拔2000米左右，年降水量在1100毫米；海拔2500-3000米，降水量多；可達1500毫米。6-9月為雨季，占全年降水量的70%，在光能資源上，年日照平均時數為1889.5小時；海拔840米，在全省處于中低值區。

水文

藥山國家級自然保護區河流屬金沙江水系，各大小河流呈放射狀自轎頂山流出，進入金沙江與牛欄江。長度大于10千米的河流約11條，河床坡降比大，水流湍急，河水經流量的季節性很強，雨季（5-10月）汛期經流量占全年的75%，旱季因降雨少，河水經流由地下水補給。地下水的主要形式有孔隙水，裂隙水和巖溶水三種，其中風化玄武巖裂隙水是保護區主要的地下水類型。

地質地貌

藥山是烏蒙山脈的西支，為金沙江與其支流牛欄江的分水嶺。呈北南走向。主峰轎頂山海拔4041.5米，為滇東北高峰，山頂與河谷間的相對高差達3500米，在大地構造上地處古楊子板塊的西部，為滇東臺褶帶組成部分，其西部邊緣是中國的小江斷裂帶。保護區的地層層序清楚，構造形態和構造運動遺跡完好，既有古陸板塊內的古裂谷活動遺跡，又有新構造成運動痕跡。第四紀冰川活動遺跡完整而典型，古生代以來的地質地貌演化，深刻地影響了這一地區的地理特征在地貌區劃類型上。屬滇東岔地山原區的滇東北中山山原亞區的構造溶蝕侵蝕地貌。保護區既有高山峽谷，也有斷崖巖坎，山勢險峻，山頂面為受古冰蝕作用改造的夷平面，地形平緩延綿、角峰、刃背、溧礫、槽、洼地常見，且分布有數十處大小不等的冰蝕湖。

土壤

藥山特定的地理位置和山體高度、水熱條件和植被隨高度的變化，致使不同海拔高度的土壤，其形成過程、強度和發育方向不同，形成了性狀特征截然不同的土壤類型，表現出非常明顯的垂直分布規律。從金沙江、牛欄江河谷到藥山山頂，隨著海拔的升高，依次分布有以下土壤帶：燥紅土、紅壤、西坡、黃棕壤、棕壤、暗棕壤、亞高山草甸土、高山寒漠土。土壤垂直帶譜屬于季風性帶譜系統，據基帶土壤紅壤與優勢土壤垂直帶所屬土綱（鐵鋁土、淋溶土）來看，帶譜類型系亞熱帶濕潤型，是滇東北、川西南、黔西地區具代表性的、也是典型完整的土壤垂直帶譜。

管理機構

云南藥山國家級自然保護區管理局內設辦公室、宣傳教育科、保護管理科、科研所四個副科級科室，下設東坪管理所、藥山管理所、楊家灣管理站、大村管理站、紅山管理站、大寨管理站2所4站。