麝香龜背甲上具有棱突（幼體尤為明顯），椎盾呈覆瓦狀；棕色或橙色，接縫處有深色的鑲邊；可能有深色的點狀或輻射條紋狀的圖案。腹甲小，粉紅色或黃色，有一個不甚明顯的鉸鏈關節，和單枚的喉盾。僅在下巴上長有觸須。頭部有深色的斑點或條紋。雄性具有末端呈刺狀的大尾巴；而雌性尾巴的末端，僅只剛剛能夠到背甲的邊緣。

麝香龜是典型的雜食性動物，舉凡植物、甲殼類、小魚、昆蟲甚至是動物殘骸等無所不吃。不過它們的覓食主要是在水底的污泥上進行，因為它們是極少離開水面的。麝香龜的名字來自于此類龜的一個共同的特性，當它們受到驚擾時都會由射香腺釋放出一種味道刺鼻的液體，以嚇阻略食者，而且雄龜也特別具有攻擊性。麝香龜是屬于夜行性的龜類，白天多埋身泥底休息到黃昏時才開始活動，覓食通常不會游泳而是在水底行走長時間生活在水底，也造成龜殼上長滿藻類，當溫度低于10°C時它們會進入水底污泥中冬眠。