金華市婦幼保健院始建于1983年,前身是金華地區婦幼保健站,1994年改名為金華市婦幼保健所,1995年撤所建院,是集預防、保健、醫療、科研為一體的二級甲等婦幼保健院,是上海市兒童醫院指導醫院,浙江大學醫學院附屬婦產科醫院金華分院,浙江大學附屬兒童醫院金華分院。2016年5月,與原金華市計劃生育宣傳技術指導站優化整合成立“金華市婦幼保健計劃生育服務中心”。2016年,機構調整成為金華市中心醫院下屬事業單位,醫院增掛“金華市中心醫院婦女兒童院區”牌子。
2016年8月,醫院按上級規范要求,堅持保健與臨床相結合原則,設立孕產保健部、兒童保健部、婦女保健部和計劃生育技術服務部,簡稱“四部制”,各部依據所承擔的職能設置相應的群體保健和臨床業務科室。下設有婦科、產科、婦保科、乳腺科、中醫科、男性科、普兒科、新生兒科(新生兒重癥監護室)、兒保科、內科、口腔科、產前診斷、聽力診斷等臨床保健業務科室;有影像診斷科、檢驗科、藥劑科、病理科、遺傳實驗室等醫技科室;開設產前、產后、新生兒科、普兒科、婦科五個病區。核定床位150張。
醫院以婦產科、兒科為龍頭,中醫婦科、產前診斷、中西醫結合不孕不育、盆底康復、兒童生長發育、更年期保健是醫院的六個特色專科。金華市產科質量控制中心、金華市圍產保健中心、金華市產前診斷中心、金華市產前篩查中心、金華市新生兒疾病篩查中心、金華市聽力診斷中心、金華市宮頸疾病診治中心、金華市優生優育優教中心均掛靠醫院,在全市有較大的影響力。同時負責全市9個縣(市、區)婦幼保健技術指導和業務培訓工作。
單位核定編制398名(全額編制51人),醫院目前職工468名,其中:在職在編250人,編外職工212人,退休返聘6人。高級職稱58人、中級職稱116人、市級名醫3名。目前在市中心醫院規培醫師51名、護士80名。