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山西醫科大學的前身是山西醫學傳習所，1919年創建于古城并州。1932年改為私立山西川至醫學專科學校。1940年更名為山西大學醫學專修科。1946年升格為國立山西大學醫學院。1953年獨立建校，更名為山西醫學院。1996年更名為山西醫科大學。目前學校已成為一所以醫學為主，醫工結合、醫理結合、醫文結合、醫管結合，協調發展的醫科大學，擁有以本科教育為主、本碩博多層次的完整人才培養體系，形成了“醫理博精、德能高邃”校訓、“獻身、務實、團結、進取”校風和“求實精進、堅韌弘毅”的山醫精神。

學校是全國第三批、山西省首批博士學位授權單位，全國首批碩士學位授權單位，全國首批學士學位授權單位，教育部首批“卓越醫生教育培養計劃”試點單位，國家中西部高校基礎能力建設工程支持高校。學校是新中國最早建立核醫學專業的高校之一，是全國衛生系“老六所”之一、全國 18所高水平公共衛生學院建設高校之一，是首批教育部批準建立法醫學專業的高校之一，是全國首批恢復兒科學本科專業的8所醫學院校之一。學校獲贈2019年9月6日在天安門廣場升起的國旗。“紅石榴”工作室被中共中央、國務院授予“全國民族團結進步模范集體”。

學校現有國家重點學科——生理學，教育部重點實驗室——細胞生理學實驗室、煤炭環境致病與防治重點實驗室，省部共建協同創新中心——分子影像精準診療協同創新中心，國家衛生健康委重點實驗室——塵肺病重點實驗室，國家級示范中心——臨床技能實訓中心、基礎醫學實驗教學中心、臨床教學培訓示范中心，國家臨床重點專科——重癥醫學、泌尿外科學、中醫護理學、骨科學、腎病學、普通外科學、老年病學、急診醫學、風濕免疫學、護理學、病理學、眼科學、心血管內科、神經外科，呼吸內科。還有一級學科設有博士后科研流動站——臨床醫學、公共衛生與預防醫學、特種醫學、生物學，一級學科博士學位授權點——特種醫學、臨床醫學、公共衛生與預防醫學、基礎醫學、護理學、藥學，博士專業學位授權點——臨床醫學、口腔醫學，一級學科碩士學位授權點——特種醫學、臨床醫學、公共衛生與預防醫學、基礎醫學、口腔醫學、護理學、藥學、醫學技術、馬克思主義理論、心理學，碩士專業學位授權點——臨床醫學、口腔醫學、公共衛生、護理、藥學、應用心理、社會工作、圖書情報。

學校現有國家一流本科專業建設點——臨床醫學、預防醫學、法醫學、藥學、護理學、麻醉學、口腔醫學、醫學檢驗技術、兒科學、基礎醫學、臨床藥學、衛生檢驗與檢疫。國家級特色專業建設點——臨床醫學（五年制）、臨床醫學（農村定向免費生）、護理專業為教育部首批國家“本科教學工程”地方高校本科專業綜合改革試點專業。學校設有臨床醫學（五年制、“5+3”一體化）、預防醫學、法醫學、口腔醫學、兒科學、醫學影像學、麻醉學、護理學、精神醫學、眼視光醫學、藥學等本科專業。

1919年8月，山西中醫改進研究會創辦山西醫學傳習所，所內教職員多為研究會理事、名譽理事等兼任。所址初在國民師范學校東院，后遷入新民中街（川至醫專）新址。山西醫學傳習所學制為一年半，共招3期7個班。1922年2月，學制改為兩年，共招3期6個班。至1926年12月，傳習所共有畢業生640人。

1921年8月，醫學傳習所改名為“山西醫學專門學校” （傳習所各班繼續辦），學制四年，招生對象為有中等學校八學期程度者，共招生3班，畢業106人。

1928年8月，學校改名為“山西醫學專科學校”，至1930年8月，招收4個專科班：2個中醫班，2個西醫班，4個班共畢業學生214人。

1932年1月，學校改名為“私立山西川至醫學專科學校”，學制仍為4年，中西醫兼授。

1934年6月，學校變為主授西醫課程。

1940年，私立山西川至醫學專科學校并入山西大學，更名為山西大學醫學專修科。

1946年8月，學校改為國立山西大學醫學院。

1949年8月，太原市軍管會作出決定，在山西大學醫學院與山西省立川至醫學專科學校合并的基礎上，將長治白求恩國際和平醫學專科學校及省立高級助產職業學校同時合并到山西大學醫學院。

1953年，全國進行院系調，高等教育部批準山西大學醫學院獨立建院，更名為山西醫學院，歸衛生部領導，省衛生廳代管。

1954年，學校改由省教育廳管理。

1990年8月，省政府同意將正在籌建的山西省汾陽高級護理學校改為山西醫學院汾陽專科部，歸山西醫學院直接領導和管理。

1996年，國家教委和省政府批準將山西醫學院更名為山西醫科大學。隨之山西醫學院汾陽專科部改為山西醫科大學汾陽學院。

2000年4月，省教委同意該校成立山西醫科大學職業技術學院。同時，省教委批準設立了山西醫科大學大同學院。該學院設在大同醫學專科學校屬山西醫科大學的二級學院。

2002年，省政府批準山西醫科大學與山西中日友好學院聯合舉辦山西醫科大學晉祠學院作為山西醫科大學的二級學院。

2003年2月，省政府批準山西醫科大學與運城衛生學校聯合舉辦山西醫科大學運城學院；8月，省政府批準山西醫科大學與晉中市衛生學校聯合舉辦山西醫科大學晉中學院。

2018年3月，山西省編辦批準臨汾市人民醫院、運城市中心醫院、太原市中心醫院、忻州市人民醫院、呂梁市人民醫院、晉中市第一人民醫院、太原市精神病醫院（山西省精神衛生中心）等7所三級甲等地市級醫院或專科醫院成為山西醫科大學直屬附屬醫院。

2020年2月21日，山西省編辦批復太原市第四人民醫院成為山西醫科大學直屬附屬醫院，名稱為“山西醫科大學附屬肺科醫院” ；10月19日，山西白求恩醫院掛牌成為山西醫科大學直屬附屬醫院，名稱為“山西醫科大學第三醫院”。

2023年5月，山西醫科大學-清華大學醫學院前沿醫學協同創新中心成立。

2024年10月19日，由山西省紅十字會和山西醫科大學聯合成立的“南丁格爾工作室”揭牌，該工作室為山西省首個。

以上信息源自官網，數據截止至2025年6月，請以官網為準！