仁濟醫院建于1844年，是上海開埠后第一所西醫醫院。醫院目前由東西南北四個院區和上海市腫瘤研究所組成，是一個學科門類齊全且集醫療、教學、科研于一體的綜合性三級甲等醫院。東院位于浦東陸家嘴金融貿易區內，于1999年10月建成投入使用，占地86875平方米，建筑面積206859平方米；西院位于黃浦區中央商務區內，毗鄰外灘，占地7811平方米，建筑面積31959平方米；南院位于閔行區浦江鎮，緊鄰世博家園，于2012年12月建成投入使用，占地68497平方米，建筑面積82590平方米；北院位于巨野路靈山路，占地6667平方米，建筑面積17350平方米，于2013年7月啟用；腫瘤所位于斜土路，總建筑面積7523平方米，由癌基因與相關基因國家實驗室、腫瘤流行病學研究室、十三個相關的研究課題組、輔助部門公共服務平臺與《腫瘤》雜志編輯部組成，于2010年10月與仁濟醫院正式“院所合一”。

醫院東、西、北三個院區目前總核定床位1650張，南院核定床位600張。截止2013年底，醫院共有在編職工2511人（不含南院），其中正、副高級職稱專家328名；博導57名、碩導148名，門急診量342萬人次，手術6.39萬例，出院人數8.47萬人，平均住院日為7.9日，醫院設有50個臨床醫技科室：消化科、心內科、血液科、風濕病科、老年病科、呼吸科、腎臟科、神經內科、內分泌科、腫瘤科、腫瘤介入科、康復科、急診科、核醫學科、放射診療科、泌尿科、胃腸外科、膽胰外科、乳腺外科、骨科、心血管外科、胸外科、血管外科、神經外科、功能神經科、肝臟外科、整形外科、麻醉科、中醫科、兒科、眼科、婦產科、婦科腫瘤科、生殖醫學科、五官科、頭頸外科、皮膚科、感染科、口腔科、營養科、放射科、超聲醫學科、病理科、檢驗科、藥劑科、輸血科、內科門診、健康管理中心、變態反應科、重癥醫學科。

近年來，醫院申請到的科研項目及專利逐年遞增，包括國家的973計劃、863計劃、國家自然基金項目等，其中2013年科研經費達1.48億元。醫院還獲得多項國家科技進步獎、中華醫學科技獎、高等學校科技進步獎等；先后共有幾百人次入圍各級人才培養計劃，包括973科學家、長江特聘教授、衛生部有突出貢獻中青年專家、上海市領軍人才等。醫院與美國、加拿大、法國、比利時、德國等近十個國家的二十多所醫學院校建立了學術交流和友好合作關系。