《2025中國醫藥創新領軍人物獎》是依據《2025中國藥品研發綜合實力排行榜》、《2025中國化藥研發實力排行榜》、《2025中國中藥研發實力排行榜》、《2025中國生物藥研發實力排行榜》、《2025中國醫藥研發CRO企業榜》、《2025中國醫藥CDMO企業榜》6個排行榜排名，并選取排名前列的獲獎企業獲得入選資格。

具備入選資格的獲獎企業，將內部推薦該企業研發首席負責人，或分管研發的副總、總經理、董事長等。確定候選人后，填寫回執表提交到第十屆中國醫藥研發創新大會組委會處。2025中國藥品研發綜合實力排行榜專家委員會經過專項評估與認定，評選出年度《2025中國醫藥創新領軍人物獎》。