1992年，出任葡萄牙體育一線隊主教練。
1996-97賽季，深得羅布森重用的隨羅布森轉投巴薩。
2001年，出任萊利亞一線隊主教練，并于2001-02賽季中期率領球隊排在聯賽第五名。
2002-03賽季，帶領波爾圖奪得葡超聯賽冠軍、葡萄牙杯冠軍和歐洲聯盟杯冠軍。
2003-04賽季，不僅率領波爾圖衛冕葡超冠軍，還率隊在歐冠中奪得冠軍。
2004年7月，正式出任切爾西一線隊主教練。在執教首個賽季就奪得英超冠軍、英聯冠軍。
2005-06賽季初，率隊在英格蘭社區盾杯決賽中，奪得冠軍。
2006年，衛冕了英超冠軍，還率隊拿到了足總杯與英聯杯兩項冠軍。
2008年6月，被任命為國際米蘭一線隊主教練，率領國際米蘭在意大利超級杯決賽中歷經點球大戰擊敗羅馬，奪得意超杯冠軍，提前3輪奪得意甲冠軍。
2010年，國際米蘭成功奪得意大利杯冠軍、意甲冠軍和歐冠冠軍，加冕“三冠王”。
2010-11賽季，率領皇馬奪得國王杯冠軍。
2011年5月，率領皇馬提前兩輪奪得闊別4年的西甲冠軍。
2012-13賽季初，率隊在西班牙超級杯，奪得冠軍。
2013年6月，時隔六年重返斯坦福橋，第二次被切爾西任命為一線隊主教練。
2014年，率隊提前3輪奪得英超冠軍，還捧起英超冠軍獎杯。
2016年5月，被任命為曼聯一線隊主教練。
2016-17賽季初，在社區盾決賽中，率隊擊敗英超衛冕冠軍萊斯特城，奪得社區盾冠軍。在歐聯決賽、英聯杯中，率隊奪得冠軍。
2019年11月，擔任熱刺教練。
2021年5月，與羅馬達成執教協議，雙方簽訂了一份為期三年的合同。
2021-22賽季，在歐協聯賽場，率隊奪得歐冠冠軍。
2022年，葡萄牙足協教練獎。
2022年，歐洲協會聯賽冠軍。
2021年，IFFHS最佳俱樂部教練。
2017年，英格蘭足球聯盟杯冠軍。
2017年，歐羅巴聯賽冠軍。
2016年，英格蘭社區盾冠軍。
2015年，英格蘭足球超級聯賽冠軍。
2015年，英格蘭足球聯盟杯冠軍。
2015年，英超最佳教練。
2015年，21世紀葡萄牙最佳教練。
2013年，IFFHS最佳俱樂部教練。
2012年，西班牙足球甲級聯賽冠軍。
2012年，西班牙超級杯冠軍。
2012年，環球足球獎最佳教練。
2011年，西班牙國王杯冠軍。
2011年，國際足聯最佳教練。
2011年，IFFHS最佳俱樂部教練。
2011年，歐足聯最佳陣容。
2010年，歐洲冠軍聯賽冠軍。
2010年，意大利足球甲級聯賽冠軍。
2010年，意大利杯冠軍。
2010年，意甲奧斯卡最佳教練。
2009年，意大利足球甲級聯賽冠軍。
2009年，意甲奧斯卡最佳教練。
2008年，意大利超級杯冠軍。
2007年，英格蘭足總杯冠軍。
2007年，英格蘭足球聯盟杯冠軍。
2006年，英格蘭足球超級聯賽冠軍。
2006年，IFFHS最佳俱樂部教練。
2006年，英超最佳教練。
2006年，歐足聯最佳陣容。
2005年，英格蘭足球超級聯賽冠軍。
2005年，英格蘭足球聯盟杯冠軍。
2005年，英格蘭社區盾冠軍。
2005年，IFFHS最佳俱樂部教練。
2005年，英超最佳教練。
2005年，歐足聯最佳陣容。
2005年，歐足聯最佳教練。
2004年，歐洲冠軍聯賽冠軍。
2004年，葡萄牙足球超級聯賽冠軍。
2004年，歐足聯最佳陣容。
2004年，歐足聯最佳教練。
2003年，葡萄牙足球超級聯賽冠軍。
2003年，葡萄牙杯冠軍。
2003年，葡萄牙超級杯冠軍。
2003年，歐洲聯盟杯冠軍。
穆里尼奧是世界最佳主帥，因為穆里尼奧是一個很直接的人，他的球員也曾經告訴我，他是一個有話就當面說的人。（拜仁名宿洛塔爾·馬特烏斯評）
穆里尼奧是世界上最好的教練，事實上在眾多優秀教練中挑出一個最好的并不容易，不過他已經在不同的國家取得了巨大的勝利。（時任巴塞羅那主教練何塞普·瓜迪奧拉評）
在所有球隊的主教練中，意大利國際米蘭主教練穆里尼奧是當之無愧的最佳教練。（“球王”迭戈·馬拉多納評）
穆里尼奧是一個成功的男人，一個贏家。他配得上最佳教練的榮譽，我認為他打造了最好的球隊陣容。（曼聯功勛教練亞歷克斯·弗格森評）
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