南京大學物理學科創立于1915年的南京高等師范學校(物理學系建立于1920年),是我國高等院校中創立最早的物理學科之一。現有“物理學”國家一級重點學科,覆蓋理論物理、凝聚態物理、聲學、光學、原子分子物理、粒子物理核物理、生物物理與軟物質、原子與分子團簇物理、應用電子學與技術物理等,其中“理論物理學”、“凝聚態物理”、“聲學”為國家二級重點學科。“物理學”博士后流動站是全國優秀博士后流動站。物理學專業入選國家級一流本科專業建設點、國家級特色專業。在教育部第4次全國高校學科評估中,物理學科被評為A。
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